Озеро питается южной рекой Эвасо Нг'иро и также богатыми минералом горячими источниками. Натрон довольно мелок, меньше чем три метра глубиной, и изменяется по ширине в зависимости от его уровня воды, меняющегося из-за высоких уровней испарения, оставляя концентрации соли и других полезных ископаемых, особенно карбоната натрия. Окружающие ландшафты горячи, очень сухи и пыльны, что не очень способствует путешествию. Но те, кто действительно принимает решение посетить Натрон, вознаграждены видением самого драматического пейзажа, который только можно запечатлеть в Танзании. Поездка стоит того ради одних только местных пейзажей.

У озера есть темно-красная цветная область, где происходят очень высокие темпы испарения. Поскольку вода испаряется в течение сухого сезона, увеличение уровней солености происходит до такой степени, что любящие соль микроорганизмы начинают процветать. Такие организмы включают некоторые цианобактерии, задействованные в фотосинтезе. Красный дополнительный пигмент фотосинтезирования производит темно-красные оттенки открытой воды озера и оранжевых цветов мелких частей озера. Щелочная корка соли на поверхности также часто окрашивается в красный или розовый цвет любящими соль микроорганизмами, что живут в водах Натрона.